Alternatyvių degalų įstatymo projekte siūlomas teisinis reglamentavimas neužtikrins pakankamo skaidrumo bei gali sudaryti prielaidas pasireikšti korupcijai. Tokias išvadas teikia Specialiųjų tyrimų tarnyba (STT), atlikusi Alternatyviųjų degalų įstatymo, Atsinaujinančių išteklių energetikos įstatymo ir Gamtinių dujų įstatymo projektų antikorupcinį vertinimą.